গ্লিসারিন নিজে ক্ষতিকর নয় বরং এটি একটি নিরাপদ ও প্রচলিত উপাদান। তবে গ্লিসারিন ভুল ব্যবহার বা অতিরিক্ত ব্যবহার থেকে সমস্যা দেখা দিতে পারে। চর্ম বিশেষজ্ঞরা বলছেন, গ্লিসারিন বাতাস থেকে পানি টেনে ত্বকে আনে। কিন্তু যদি বাতাস শুষ্ক হয়, তখন এটি ত্বকের ভেতর থেকেই পানি টেনে নেয়, ফলে—ত্বক আরও শুষ্ক হয়ে যেতে পারে। শুষ্ক চুলে ব্যবহার করলে ফ্রিজি বা আরও খসখসে হতে পারে। ত্বকে সরাসরি শুধু গ্লিসারিন ব্যবহার করা ঠিক নয়।

সরাসরি গ্লিসারিন লাগালে ত্বক টান টান লাগে, জ্বালা বা চুলকানি হতে পারে, অতিরিক্ত আঠালো লাগে।

গ্লিসারিন সাধারণত তৈলাক্ত বা ব্রণপ্রবণ ত্বকে সমস্যা তৈরি করে। কারণ এর ব্যবহারে অতিরিক্ত আঠালোভাব হয়, মুখে ঘাম, ধুলো আটকে ব্রণ বেড়ে যায়। গ্লিসারিন ত্বকে আঠালো হওয়ায় রোদে লেগে স্টিকি লাগে, ঘাম বাড়ে এবং বাইরে গেলে ধুলো ময়লা লেগে যায়। 

অনেকে চুলে গ্লিসারিন ব্যবহার করে থাকেন। মনে রাখবেন ভুলভাবে ব্যবহার করলে সমস্যা দেখা দিতে পারে। বেশি গ্লিসারিনে চুল ফ্রিজি হয়। আর্দ্রতা কম থাকা পরিবেশে চুল শুকিয়ে যায়। খুব সামান্য পরিমাণে গ্লিসারিন ব্যবহার করলে ত্বকে বা চুলে সমস্যা হয় না। শুষ্ক ত্বকে, রাতে গ্লিসারিন ব্যবহার করা যেতে পারে এবং হেয়ার মাস্ক বা কন্ডিশনারে অল্প পরিমাণে ব্যবহারে তেমন সমস্যা হয় না।