সাহিত্যিক আবু ফাতেমা মুহাম্মদ ইসহাক তাঁর লেখনীর মাধ্যমে মুসলিম রেনেসাঁ, ধর্মীয় ব্যক্তিত্ব এবং সাহিত্যিক চিন্তাধারার এক মূল্যবান মেলবন্ধন ঘটিয়েছেন। তাঁর গ্রন্থ ‘মুসলিম রেনেসাঁয় নজরুলের অবদান’ আধুনিক বাংলা সাহিত্যে মুসলিম চিন্তা ও সামাজিক চেতনায় জাতীয় কবি কাজী নজরুল ইসলামের প্রভাব নিয়ে গভীর আলোচনা করে। বইটি প্রথম প্রকাশিত হয় ১৯৭০ সালে, পরে ১৯৮৭ সালে নতুন সংস্করণ এবং ২০১৪ সালে পুনর্মুদ্রিত হয়।

তাঁর আরেকটি গুরুত্বপূর্ণ কাজ হলো ‘ফুরফুরার পীর হজরত মওলানা আবুবকর সিদ্দিকী’। ইসলামিক ফাউন্ডেশন থেকে প্রকাশিত এই জীবনীমূলক গ্রন্থে তিনি ফুরফুরার প্রখ্যাত পীর হজরত মওলানা আবুবকর সিদ্দিকীর জীবন ও কর্ম বিস্তারিতভাবে তুলে ধরেছেন। এই রচনার জন্য তিনি বিভিন্ন ইসলামী প্রকাশনা এবং মরহুম ডক্টর শহীদুল্লাহর ‘ইসলাম প্রসঙ্গ’ বইয়ের সাহায্য নিয়েছেন।

আবু ফাতেমা মুহাম্মদ ইসহাক ‘পত্রে মুসলিম তামাদ্দুন’ গ্রন্থে পত্রসাহিত্যের মাধ্যমে ইসলামি বিশ্বাস ও চিন্তার বিভিন্ন দিক তুলে ধরেছেন। এই বইয়ে তাঁর লেখা দীর্ঘ পত্রগুলো যেমন তথ্যসমৃদ্ধ, তেমনি ভাষা অত্যন্ত সুগঠিত ও মার্জিত। তাঁর এই কাজগুলো বাংলা সাহিত্যে ইসলামি ভাবধারা ও সামাজিক চেতনার এক নতুন দিগন্ত উন্মোচন করেছে।